Moleküler yapılı elementler, kendisinden başka madde bulundurmayan saf maddeler olarak tanımlanır. Saf maddeler, bileşikler ve elementler olarak iki ana başlık altında incelenir. Elementler, yapısında tek cins atom bulunduran saf maddelerdir. Elementlerin yapı birimleri atomlardır ve bu atomlar fiziksel veya kimyasal yöntemlerle daha basit maddelere ayrıştırılamazlar.

Bir elementi meydana getiren tüm atomların büyüklükleri ve bu atomlar arasındaki mesafeler aynıdır. Ancak bir elementin atomları ile farklı bir elementi meydana getiren atomlar arasında mesafe ve atom büyüklükleri farklıdır. Yani her elementin atomları kendine özgüdür ve kendilerine özgü yoğunlukları, atom ağırlıkları vardır. Aynı element kullanılarak yapılmış farklı maddeler de aynı cins atomlardan meydana gelir.

Elementi meydana getiren atomların birbirlerine olan mesafeleri, elementin katı, sıvı veya gaz haline göre değişebilir. Katı maddelerde atomlar arasındaki mesafe yok denecek kadar azdır; sıvı maddelerde bu mesafeler biraz daha fazladır ve gazlarda atomlar arasındaki mesafe en fazladır. Hem canlı hem de cansız varlıklar elementleri yapısında bulundurur. Elementler sembollerle ifade edilirler.

Bazı elementleri meydana getiren atomlar doğada yalnız başına bulunurlar. Bu şekilde atoma sahip olan elementler atomik yapılı element olarak tanımlanır. Atomik yapılı olan elementlerin en küçük yapı birimi atomlardır. Atomik yapılı element örnekleri; demir (Fe), bakır (Cu), alüminyum (Al), çinko (Zn), kurşun (Pb) ve altın (Au) elementleridir.

Bazı elementleri meydana getiren atomlar doğada ikili ya da daha fazla sayıda, karmaşık yapılı olarak bulunur. Bu şekilde atomlara sahip olan elementler moleküler yapılı element olarak tanımlanır. Moleküler yapılı olan elementlerin en küçük yapı birimi moleküllerdir. Molekül, iki veya daha fazla sayıda atomun bağlar ile bağlanıp meydana getirdiği atom grubudur.

Moleküler yapılı element örnekleri; iyot (I), oksijen (O), hidrojen (H), karbon (C), fosfor (P), azot (N) ve kükürt (S) elementleridir.